A escolha do tratamento depende da natureza do lipoma e de sua localização. Se o lipoma não causa desconforto, não requer nenhum tratamento especial.

No entanto, é aconselhável monitorar um lipoma não operado para ver se ele não cresce ou se torna constrangedor.

O tratamento de um lipoma problemático envolve cirurgia, lipoaspiração ou remoção do lipoma (lipectomia). Quando um lipoma é operado, ele é sistematicamente enviado a um laboratório para análise.

A lipoaspiração causa menos cicatrizes, mas deixa o envelope do lipoma no lugar e aumenta o risco de recorrência.

No caso de vários lipomas subcutâneos, ou no caso de uma pessoa que não pode ser operada, uma alternativa é injetar corticosteróides no lipoma para reduzir seu volume.